MonBUG - June/Juin

Joignez-vous à nous le mardi 21 juin à 16h30 pour écouter Dr Martin Smith Professeur-chercheur en bio-informatique à l'Université de Montréal et au centre de recherche du CHU Sainte-Justine.

Titre : Exploration du domaine électrisant du séquençage nanopore : Algorithmes et applications dans l'espace du signal.

Résumé :
Le séquençage nanopore révolutionne l'accessibilité et la sensibilité de la recherche en génomique. Autrefois stigmatisés pour leur taux d'erreur élevé, les derniers logiciels rivalisent, voire surpassent, les autres plates-formes de séquençage. La clé de ces progrès est l'étude des données brutes de Nanopore, une série chronologique de courants électriques qui caractérisent les polymères biologiques en transit.
Je présenterai un aperçu des forces et des défis d'Oxford Nanopore Technologies pour l'étude multi-omique, en mettant notamment l'accent sur les algorithmes et les stratégies bioinformatiques propres à la plateforme (par exemple, le signal brut et les analyses en temps réel). Je décrirai également quelques exemples spécifiques de la manière dont nous utilisons le séquençage Nanopore dans nos recherches.

• Domaine de recherche: https://recherche.chusj.org/fr/Axes-de-recherche/Bio?id=720e6d28-01e3-48f6-9c3b-18936c9a1c87
• Deux façons de se joindre:

via jitsi (lien disponible au RSVP)
via YouTube Live: https://youtu.be/VNM0vV3gmUo

À bientôt!

PS: Si vous désirez présenter dans un événement futur, contactez-nous via Meetup ou à info[AT]monbug.ca.

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Join us this June 21 at 4:30pm to listen to Dr Martin Smith
Professor-researcher in bioinformatics at the University of Montreal and at the CHU Sainte-Justine research center.

Title : Exploring the electrifying field of nanopore sequencing: Algorithms and applications in signal space.

Resume :
Nanopore sequencing is revolutionizing the accessibility and sensitivity of genomics research. Once stigmatized for its high error-rate, the latest software and chemistries rival if not outperform other sequencing platforms. Key to these advancements are the study of raw Nanopore data–a time series of electrical current that characterize transiting biological polymers.
I will present an overview of the strengths and challenges of Oxford Nanopore Technologies for the study of multi-omics, with notable emphasis on algorithms and bioinformatics strategies that are unique to the platform (e.g. raw signal and real-time analyses). I will also describe a few specific examples of how we are using Nanopore sequencing in our research.

• Research area : https://research.chusj.org/en/Axes-de-recherche/Bio?id=720e6d28-01e3-48f6-9c3b-18936c9a1c87
• Two ways to join the meeting :

via jitsi (link available on RSVP)
via YouTube Live: https://youtu.be/VNM0vV3gmUo

See you soon!

PS: If you want to present in a future event, contact us via Meetup or by email at info[AT]monbug.ca