Name: Dream Challenges Hackathon
Start: 2016-07-15T17:45:00-04:00
End: 2016-07-16T17:45:00-04:00
Location: Vieux Port de Montréal

Update (17:30). I've just been told that tickets are still available on the HackerFest website despite the site saying they were sold out earlier.

Mise à jour (17:30). On vient de me dire que c'est toujours possible d'acheter des billets en-ligne sur le site de HackerFest même si le site indiquait plus tôt que tous les billets avaient été vendus.

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The Dream Challenges hackathon will take place within the HackerFest of the Startupfest. You can register right now on the HackerFest website. Just pick the biohackathon option when you register.

http://www.startupfestival.com/hackerfest

We're going to have a tent in the Old Port of Montreal for 24 hours, with power, Internet and all other amenities provided to us, where we can hack on some challenging bioinformatics problems involving machine learning.

We're going to be working on the DREAM challenges. There will be prizes for the winners of the hackathon (The MonBUG t-shirts have finally been ordered). The DREAM challenges organizers also provide their own rewards, ranging from authorship in publications to significant cash rewards for one of the challenges.

The 15$ registration fee for the hackathon includes coffee, snacks, and breakfast. The site will be open only to those who officially registered from 17:00 Friday to 10:00 Saturday. You may be able to drop by Saturday after 10:00 without registering. I would really encourage you to officially register though to support the event.

There will be 5 DREAM Challenges open for hacking. http://dreamchallenges.org

The Digital Mammography DREAM Challenge (https://www.synapse.org/Digital_Mammography_DREAM_Challenge)
Disease Module Identification DREAM Challenge (https://www.synapse.org/modulechallenge)
Respiratory Viral DREAM Challenge (https://www.synapse.org/#!Synapse:syn5647810)*ENCODE-DREAM in vivo Transcription Factor Binding Site Prediction ChallengeICGC-TCGA DREAM Somatic Mutation Calling RNA Challenge (SMC-RNA) (https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2813589/wiki/401435)

At the end of the hackathon, you will present your work on the challenges. We'll decide the winners based on your presentations. The DREAM challenges are open for several months, so you don't need to share all your code at the end of the hackathon if you don't want to. You can share with us what you wish to share, if only your position on the leaderboard, and what you were able to accomplish within the time frame of the hackathon. If you want to continue working on the challenges after the hackathon, you'll also have the opportunity to present all your work at one of MonBUG's meetings once the challenges have closed.

The hackathon is being held in collaboration with Kevin Chen's Bricobio group. Thanks to Kevin for inviting us!

Most of us come from academia, but the organizers are enthusiastic about having bioinformaticians participate. There will be many excellent programmers at the event, and opportunities for collaborations.

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Le hackathon aura lieu dans le cadre du HackerFest du Startupfest. Vous pouvez vous inscrire tout de suite sur le site du HackerFest. Vous n’avez qu’à choisir l’option biohackathon lors de l’inscription.
http://www.startupfestival.com/hackerfest

Nous allons disposer d’une tente dans le Vieux Port de Montréal pour 24 heures, avec tout le nécessaire fourni (courant, Internet, …). Nous pourrons y travailler sur des défis bioinformatiques impliquant l’apprentissage machine.

Il y a des frais d’inscription de 15$, mais ces frais incluent le café, les collations et le petit déjeuner. Le site sera ouvert uniquement aux participants officiellement inscrits de vendredi 17:00 à samedi 10:00. Vous devriez pouvoir entrer dans le site et participer au hackathon sans inscription après samedi 10:00, mais je vous encourage à vous inscrire officiellement pour soutenir l'événement.

Il y aura 5 DREAM challenges.

The Digital Mammography DREAM Challenge (https://www.synapse.org/Digital_Mammography_DREAM_Challenge)
Disease Module Identification DREAM Challenge (https://www.synapse.org/modulechallenge)
Respiratory Viral DREAM Challenge (https://www.synapse.org/#!Synapse:syn5647810)* ENCODE-DREAM in vivo Transcription Factor Binding Site Prediction Challenge ICGC-TCGA DREAM Somatic Mutation Calling RNA Challenge (SMC-RNA) (https://www.synapse.org/#!Synapse:syn2813589/wiki/401435)

À la fin du hackathon, vous pourrez présenter votre travail à vos collègues. Nous déciderons les gagnants en se basant sur vos présentations. Les DREAM challenges sont ouverts pendant plusieurs mois, donc vous n'avez pas à partager tout votre code avec nous si vous ne voulez pas. Si vous voulez vous pouvez partager avec nous que votre rang sur le tableau des classements. Vous aurez aussi l'opportunité de partager avec nous votre l'ensemble de votre travail à une réunion de MonBUG après la fermeture des DREAMS challenges.

Le hackathon est tenu en collaboration avec Bricobio de de Kevin Chen. Merci à Kevin de nous avoir invité!

La plupart d'entre nous proviennent du monde académique, mais les organisateurs du Startupfest ont enthousiasment encouragé notre participation à l'événement. Il y aura d'excellents programmeurs sur place, et de belles opportunités de collaboration.

Alexis Blanchet-Cohen

Tariq Daouda

Nicole Uwimana

Kevin Chen

Josette-Renee Landry

MonBUG - Montreal Bioinformatics User Group

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Dream Challenges Hackathon

Vieux Port de Montréal

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